«Убийца по имени Неро» разворачивает свою историю во Франции начала XVI века, в эпоху, где за фасадом роскоши таится грубая жестокость. Мы встречаем главного героя в момент, когда вся его жизнь, построенная на хладнокровном ремесле, внезапно теряет всякий смысл.

Причина этому – юная девушка, оказавшаяся его дочерью. Её появление вырывает Неро из привычного мира заказных преступлений и заставляет впервые в жизни не наносить удар, а закрыть собой от опасности. Вместе они вынуждены пуститься в бег, спасаясь от могущественных врагов, для которых эта девушка – ключ к чему-то очень важному.

Их погоня – это не просто физическое перемещение. Это путешествие сквозь мрак прошлого самого Неро и тёмных сил, которые, кажется, намного больше, чем просто люди. Сериал держит в напряжении, заставляя гадать, сможет ли человек, знающий только смерть, научиться защищать жизнь.